Отдел состоит из 20 сотрудников. В состав отдела входит два производственных участка – садковый и бассейновый.
Садковый участок занимается формированием ремонтно-маточных стад сиговых видов рыб и форели. Бассейновый участок – формирование  маточного стадо сибирского осетра и стерляди (Обь-Иртышская популяция).
Функции отдела:
- контроль и ведение хозяйственной деятельности производственных участков;
- оформление разрешительной и отчетной документации в сфере природопользования;
- проведение комплекса работ направленных на возмещение ущерба водным биоресурсам в результате хозяйственной деятельности предприятий;
- реализация икры и личинок ценных видов рыб для целей рыбоводства предприятиям региона, экспортные поставки за рубеж;
- проведение  оперативной работы по организации поставок необходимых материалов, сырья, нефтепродуктов, техники и оборудования;
- анализ итогов работы и представление установленной статистической отчетности по воспроизводству рыбных запасов;
- подготовка деловых писем и документов по профилю своей деятельности и ведение делопроизводства;
- организация работы по заготовке производителей, сбору и инкубации икры ценных видов рыб для целей воспроизводства и рыбоводства, по выращиванию и выпуску молоди рыб в естественные водоёмы;
- оформление, учет и контроль выполнения хозяйственных договоров в сфере деятельности отдела.